Pues después de abrir el archivo, lo lees con io.read(). Te devolverá una línea del archivo, o todo el texto (depende de cómo la uses). Yo optaría por leer todo el texto, y separarlo en una tabla ( plugs = string.explode(texto_leído,"\n") supongo que serviría). De esta manera, la línea 1 del archivo estaría en plugs[1], la línea 2 en plugs[2] y así sucesivamente.

Con la tabla llena, mostrar la lista es juego de niños (con un triste ciclo for xD). Ahora, un selector tampoco es cosa del otro mundo, te recomiendo que revises los tutos que han colgado sobre cómo hacer menus, es el mismo principio para el selector de tu lista.

Activar o desactivar plugins de la lista... ahora mismo no se me ocurre algo práctico, parte del punto que los plugins llevan un 1 o 0 al final de la línea indicando su estado... supongo que string.gsub() serviría.
Un ejemplo:

function toggle(txt,valor)
	return string.reverse(string.gsub(txt:reverse(),"%d xrp.",valor.." xrp."))
end
 
--[[
txt es la línea q modificarás
valor, el número q tendrá al final la línea (1 o 0)
Usarla es sencillo...
--]]
 
plug = "un plugin cualquiera.prx 1"
 
--Que lo quiero deshabilitar?
plug = toggle(plug,0)
 
--Que lo quiero habilitar? (ya estaba habilitado, pero yo lo quiero habilitar otra vez xDD)
plug = toggle(plug,1)

EDITO: Se me olvidaba... esa función no furula si al final de la línea no hay un número (por ejemplo, que sólo esté la dirección del plugin). Te toca solventar eso también xD