Lo ideal sería que hicieras el código preparado para volver a tal punto cada vez que quisieras, sería un code bonito y eficaz. El truco del dofile serviria, siempre y cuando volvieras a descargar todo antes del dofile, para luego volverlo a cargar, algo un tanto peculiar y no eficaz. Otra manera, solo en CFW, seria os.runeboot("EBOOT.PBP"); pero ya digo, sólo CFW. Así que mi recomendación es que reestructuraras tu código para que se pudiera ejecutar infinidad de veces. Un saludo.

No estoy seguro pero prueva con esto 

if controls.start() then 
dofile.lua() 
-- o prueva con esto 
if controls.start() then
dofile.lua
-- Pero creo que era con () 

Me lo enseñó Irving Prog ;)

PD : Eso con el 

controls.read() antes de todo ;)

el start lo puedes cambiar por el boton que quieras ;)