segun tengo entendido, cuando le ponen una tapa de joystick diferente al original (por ejemplo uno mas alto), sucede que se hace mas palanca de la necesaria al mover este y ocasiona que el desgaste sea mayor al normal ocasionando que el lado que mas se ocupe falle al corto tiempo, no queda mas remedio que reemplazar el joystick, te recomiendo que ocupes la tapita original para evitar eso de nuevo.

en cuanto a los tornillos si estan barridos (supongo que te refieres a la cabeza del tornillo), lo mejor es usar un pequeño taladro con una broka menor a la cabeza del tornillo, y a muy baja velocidad y girando esta en sentido de sacar el tornillo, haces un poco de presion sobre la misma y aumentas la presion hasta cuando empieces a sentir que la cabeza esta empezando a girar, pero siempre a la mas baja velocidad dejas que suba con cuidado, es delicado el proceso asi que hazlo con calma y en un lugar fijo y limpio.

PSP Slim 5.50Gen-D3 (full)